MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017821	ATT	3	9	6	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017821	TA	3	6	50	55	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017821	ATA	2	6	59	64	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017821	AAT	2	6	73	78	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017821	TAA	2	6	99	104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017821	TTA	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017821	ACT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017821	TAA	2	6	249	254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017821	TAAAA	2	10	263	272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017821	CAA	2	6	295	300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017821	TATCAT	2	12	320	331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017821	TAA	2	6	354	359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017821	AAT	2	6	360	365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017821	TAAA	2	8	386	393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017821	TAAA	3	12	399	410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017821	CAA	2	6	444	449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017821	AT	3	6	456	461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017821	TC	3	6	470	475	0 %	50 %	0 %	50 %	386858649
19	NC_017821	TCA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858649
20	NC_017821	T	8	8	514	521	0 %	100 %	0 %	0 %	386858649
21	NC_017821	AAT	2	6	527	532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858649
22	NC_017821	T	8	8	563	570	0 %	100 %	0 %	0 %	386858649
23	NC_017821	T	6	6	637	642	0 %	100 %	0 %	0 %	386858649
24	NC_017821	TAA	2	6	666	671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858649
25	NC_017821	AGA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858649
26	NC_017821	TA	3	6	703	708	50 %	50 %	0 %	0 %	386858649
27	NC_017821	CTC	2	6	709	714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858649
28	NC_017821	TA	3	6	751	756	50 %	50 %	0 %	0 %	386858649
29	NC_017821	CTT	2	6	819	824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858649
30	NC_017821	TA	3	6	826	831	50 %	50 %	0 %	0 %	386858649
31	NC_017821	ATC	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858649
32	NC_017821	ACC	2	6	965	970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858649
33	NC_017821	TAT	2	6	1002	1007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858649
34	NC_017821	AGAT	2	8	1036	1043	50 %	25 %	25 %	0 %	386858649
35	NC_017821	ATA	2	6	1079	1084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858649
36	NC_017821	CCT	2	6	1085	1090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017821	TA	3	6	1118	1123	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
38	NC_017821	A	7	7	1148	1154	100 %	0 %	0 %	0 %	386858650
39	NC_017821	AT	3	6	1179	1184	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
40	NC_017821	T	7	7	1189	1195	0 %	100 %	0 %	0 %	386858650
41	NC_017821	A	6	6	1259	1264	100 %	0 %	0 %	0 %	386858650
42	NC_017821	TAA	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858650
43	NC_017821	A	7	7	1334	1340	100 %	0 %	0 %	0 %	386858650
44	NC_017821	ACA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858650
45	NC_017821	TAT	2	6	1426	1431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858650
46	NC_017821	TA	3	6	1495	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
47	NC_017821	ATC	2	6	1507	1512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858650
48	NC_017821	T	7	7	1531	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	386858650
49	NC_017821	TTA	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858650
50	NC_017821	TAT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858650
51	NC_017821	TTA	2	6	1661	1666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858650
52	NC_017821	AT	4	8	1693	1700	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
53	NC_017821	AT	3	6	1716	1721	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
54	NC_017821	ATA	2	6	1744	1749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858650
55	NC_017821	T	6	6	1798	1803	0 %	100 %	0 %	0 %	386858650
56	NC_017821	ATA	2	6	1823	1828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858650
57	NC_017821	CCT	2	6	1850	1855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858650
58	NC_017821	T	7	7	1885	1891	0 %	100 %	0 %	0 %	386858650
59	NC_017821	T	6	6	1926	1931	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651
60	NC_017821	TATC	2	8	2000	2007	25 %	50 %	0 %	25 %	386858651
61	NC_017821	CTAA	2	8	2017	2024	50 %	25 %	0 %	25 %	386858651
62	NC_017821	T	6	6	2061	2066	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651
63	NC_017821	TA	3	6	2079	2084	50 %	50 %	0 %	0 %	386858651
64	NC_017821	AAAT	2	8	2208	2215	75 %	25 %	0 %	0 %	386858651
65	NC_017821	T	6	6	2228	2233	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651
66	NC_017821	TTGA	2	8	2235	2242	25 %	50 %	25 %	0 %	386858651
67	NC_017821	A	6	6	2262	2267	100 %	0 %	0 %	0 %	386858651
68	NC_017821	TTA	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858651
69	NC_017821	AT	3	6	2297	2302	50 %	50 %	0 %	0 %	386858651
70	NC_017821	T	9	9	2382	2390	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651
71	NC_017821	T	8	8	2400	2407	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651
72	NC_017821	CAA	2	6	2450	2455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017821	TCT	2	6	2456	2461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.